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抑郁症与心脏病的相关性遗传关联研究

来源:先心病治疗 时间:2020-8-29

第七节遗传关联研究

尽管双生子研究表明MDD和CAD共享潜在的遗传危险因素,但这些因素都被视为潜在因素,并未指明那些包含等位基因变异的影响两种疾病的实际基因网络。鉴定这些基因可能有助于阐明这两种疾病的病理生理学,而且还为遗传多效性的假设提供了一个更直接的生物学考量。

直到最近,主要的基因发现策略都是通过使用候选基因进行。鉴于人群中等位基因的频率和性状的分布,候选基因关联研究只是检验候选基因中的一个特定等位基因是否与一种性状共同发生并且概率高于随机水平[66]。基因的先验选择可能是基于基因在致病途径中的生物学作用(生理学候选基因)和/或基于该基因位置接近一个基因连锁研究的峰值(位置候选基因)。基因变异的分型——例如,单核苷酸多态性(SNPs)、重复多态性或插入/缺失多态性——将根据它们在编码、启动序列或剪接区域内的位置,或者如果已知,他们对基因产物或基因表达的功能效应,优先选择。

虽然以前的研究已经表明,即使在中等大小的样本中也可以检测到关联,标准效度计算表明,小到中等大小样本检测基因主效应至少需要1,例样本[79]。这就需要在样本收集上投入大量投资,而这种努力又必须权衡考虑候选基因方法的一个重要缺点:即它完全利用现有生物疾病模型进行。许多与疾病有关的数百或数千个基因可能没有得到正确的功能注释,或驻留在尚未与疾病发生联系的途径上。

大样本中的基因发现尝试越来越多使用全基因组关联(GWA)研究这一更不可知论的策略。GWA研究为人类基因组测序计划开发负担得起的、高精度、高通量的基因分型技术。在一项研究中,为分散在整个基因组的介于,与万之间的SNPs中的每一个体做基因分型。随着从HapMap计划获取的世界主要人群的单倍型结构信息的增加,这些SNP数据可用于在全基因组范围内检测对疾病或疾病危险因素的遗传相关性,并且对于所涉及的生物学途径没有任何先验假设。

参考文献

[66]Niiranen,A.,Laakaonen,R.,Iivanainen,M.etal.()Behavioralassessmentofpatientstreatedwithalpha-interferon.ActaPsychiatr.Scand.,78,-.

[79]Vaccarino,V.,Johnson,D.B.,Sheps,D.S.etal.()Depression,inflammation,andincident.

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